存根联一般是指已开具发票的存根联，存根联属于票据凭证的一种。发票的基本联次分为三联，第一联为存根联，由开票方留存备查;第二联为发票联，作为收执方付款或收款原始凭证;第三联为记账联，作为开票方记账的原始凭证。
根据《中华人民共和国发票管理办法》规定，开具发票的单位和个人应按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。
转账支票的存根仅仅是一种凭证，主要有以下作用：
1、查账;用来做会计凭证入账;
2、转账支票是出票人签发的，委托办理支票存款业务的银行在见票时无条件支付确定的金额给收款人或持票人的票据;在银行开立存款账户的单位和个人客户，用于同城交易的各种款项，均可签发转账支票，委托开户银行办理付款手续。转账支票只能用于转账。
支票存根联，必须连同发票、进仓单，或借据一起入账。
示例1：购进货物
借：存货
贷：银行存款。
示例2：报销费用
借：管理费用
贷：银行存款。
示例3：职员借款
借：其他应收款
贷：银行存款。